基底细胞癌可以根据发病部位，患者的年龄和身体的一般状况以及经济情况来进行不同的治疗，比如冷冻、光动力或手术治疗。一般的扩大切除手术及显微外科手术都是基底细胞癌的治疗方法，相对而言效果最好、治愈率最高、复发率最低的方法是显微外科手术。还有根据临床经验扩大切除，比如扩大0.3cm或0.5cm去切除，再缝合，这些都是在病理组织切片确诊后进行，然后定期复诊。
需要注意的是如果没有做显微外科手术，不能去做皮瓣的修复。有一些患者是浅表型的基底细胞癌或结节溃疡型基底细胞癌，可以用光动力的治疗方法。光动力是近几年非常流行的一种治疗方法，比较浅表的皮肤恶性肿瘤可以用光动力的方法进行治疗，也可以用光动力联合磨削、激光的方法进行治疗，都能达到治愈的效果，而且对其面部美观没有太大的影响。
