先天性室间隔缺损进行介入治疗时，可能会出现以下并发症：
1、心包填塞：当出现心包填塞时，应及时联系外科，请外科进行干预；
2、心律失常：可出现左束支、右束支，完全或者不完全的左右束支传导阻滞，甚至是二度、三度以上的房室传导阻滞；
3、封堵器脱落：病变解剖部位特殊或者操作治疗不当时，会出现封堵器脱落，严重者甚至出现溶血情况；
4、残余分流与溶血：当封堵器选择不当时，会出现封堵不完全，术后能出现有残余分流情况；
5、三尖瓣关闭不全：在用封堵器治疗的过程中，磁感器可能对三尖瓣肌腱造成影响时，出现三尖瓣关闭不全情况；
6、主动脉关闭不全；
7、空气栓塞：当予以介入手段治疗时，操作不当会导致空气进入导管，而引起空气栓塞导致的不良反应；
8、主动脉心房瘘；
9、其他：包括导丝、导管对心肌的损伤。