加德纳菌和HPV是两种完全不同的病原微生物，但都是以性传播作为主要传播方式的感染性病原微生物。具体区别如下：

1、加德纳菌也叫嗜血杆菌，属于细菌，即杆状菌。是引起女性生殖道感染最常见的一种杆菌，也就是一种致病微生物，会导致女性加德纳杆菌性阴道炎，或者叫嗜血杆菌性阴道炎，是一种性传播疾病；

2、HPV叫人乳头瘤病毒，属于病毒。基因分型现在发现有超过130种。根据导致宫颈癌的发生风险，分为低危型HPV病毒和高危型HPV病毒。依据所致病的细胞学类型，可以分为上皮低危、上皮高危或者黏膜低危、黏膜高危。