肾结石手术通常约1小时完成，多数在术后第2天即可出院。当结石＞0.6cm时常排出较困难，需要做钬激光碎石术治疗，病人通常需要在全麻下进行手术，取膀胱截石位，全麻成功后在输尿管镜直视下，通过输尿管开口置入超滑导丝，在超滑导丝置入后撤出输尿管硬镜。沿超滑导丝置入输尿管软镜套管，在输尿管软镜直视下可以观察肾盂各盏情况，观察结石位置、大小、形态，如结石位于肾盏，可以用钬激光光纤直视下进行碎石治疗，通常可以将结石粉碎，将较大的结石粒通过取石篮取出。
当结石较大时，通常在1.5小时左右完成。由于输尿管镜鞘有回流尿液和冲洗的作用，通常不会造成肾盂内血压增高，所以在肾结石碎石整个过程中不会导致尿液逆流，不会对肾盂产生压力作用。肾结石手术后通常需要放输尿管支架管，病人可以安返病房，多数在术后第2天即可出院。
