咽拭子的常见检测目的如下：

1、检测病原体：可以检测患者咽部的唾液或黏膜分泌物内是否存在某种病毒，在新型冠状病毒疫情期间，进行咽拭子检查，主要检测分泌物、唾液中，是否含有新型冠状病毒，可以使用新型冠状病毒的特异性探针，检查是否存在感染；

2、筛选敏感抗生素：可以检测黏膜分泌物中的细菌，是否对抗生素敏感或耐药。对在患者咽部取得的唾液、黏膜分泌物进行细菌培养，进行细菌培养后，加入不同抗生素，观察细菌的生长情况，如果加入某种抗生素后细菌立即死亡或死亡较多，可能细菌对抗生素较敏感。如果加入某种抗生素后，细菌未死亡、继续繁殖生长，此时细菌可能对抗生素不敏感。

咽拭子检查主要是从咽部黏膜取得分泌物，了解分泌物中的具体病原体，或了解分泌物的病原体对哪种抗生素敏感与否。