沙眼感染后分为初次感染和慢性期沙眼，初次感染时沙眼患者往往会出现急性结膜炎，会有眼部异物感、眼痒、眼疼、流泪，甚至有较多的结膜分泌物。

在急性期后沙眼会进入慢性期，常常在慢性期会有沙眼并发症出现，会有结膜瘢痕形成、沙眼引起干眼的情况，患者会表现出明显的眼部磨痛感和干眼症的情况。严重者会出现眼部较严重的并发症，如睑内翻、倒睫，倒睫会摩擦角膜上皮引起角膜混浊，甚至角膜炎；还会有部分患者并发有睑球粘连，影响眼睑的闭合，严重的患者会引起视力显著下降。