感染性结石首先要抗感染治疗，同时取出或者排出结石。只有当结石完全控制以后，感染性结石才会降低复发率，才能从根本上治疗感染性结石再复发。
结石和感染往往是鸡生蛋，蛋生鸡的关系，结石可以诱发泌尿系统感染，感染也可以再生成结石。
所以治疗感染性结石首先要消炎，可以通过尿细菌培养应用有效的敏感抗生素来控制感染，也可以同时应用清热解毒、利尿通淋的中药进行结石预防。
通过多喝水，通过饮食结构改变，清淡饮食，通过应用抗生素把结石排尽以后，可以很好地预防感染性结石。
往往结石存在不是一种结石，而是多种结石的混合物，如感染性结石和草酸钙结石一并存在。所以在治疗感染性结石的同时，还要降低饮食当中钙和草酸的含量，才能从根本上控制结石的复发。
