霉菌性阴道炎一般是指外阴阴道假丝酵母菌病，通常情况下，碘伏无法治疗外阴阴道假丝酵母菌病。外阴阴道假丝酵母菌病通常指白色念珠菌感染女性的外阴阴道，可导致局部出现分泌物增多、大量豆渣样白带、外阴瘙痒的症状。治疗需要使用抗真菌的药物，包括口服抗真菌的氟康唑、伊曲康唑，或阴道使用克霉唑、硝酸咪康唑，或制霉菌素等，也可以联合用药。而碘伏作为常用的消毒溶液，虽然可以起到消毒的作用，但对于已经存在，并且大量繁殖的白色念珠菌无法达到治愈作用。
真正要想治疗外阴阴道假丝酵母菌病，建议规范使用抗真菌药物，通常经过1个疗程的治疗后，停药3天进行复查，清洁度正常、菌丝消失才认为是治愈。碘伏本身虽然局部具有清洁和消毒的作用，可能有助于缓解外阴阴道假丝酵母菌病所带来的外阴瘙痒症状，但因为无法彻底根除白色念珠菌，所以单纯使用碘伏后，白色念珠菌仍然存在，复查菌丝也没有消失，因此不建议单独用碘伏来治疗外阴阴道假丝酵母菌病，而是需要使用抗真菌的药物进行治疗。
