阿莫西林本身没有引起困倦的副作用，常见副作用是消化道症状，可以出现恶心、呕吐、腹胀、食欲减退，以及过敏表现，如出现皮疹，伴有瘙痒，可以出现低烧、药物热，偶尔出现失眠、兴奋、头晕等。如果患者出现困倦，需要注意是否存在肝损伤，因为阿莫西林可以损伤肝脏，而且与服用剂量、服用天数没有关系。阿莫西林可以引起特异体质的肝损伤，特异体质的肝损伤出现几率相对不高，多数患者不会出现。
如果患者出现明显困倦，要注意是否出现肝损伤，因为肝脏受损之后常表现为乏力、倦怠，也可以伴有消化道症状，如食欲减退、恶心、腹胀，甚至出现厌油腻。阿莫西林引起肝损害之后，常引起胆管受损，所以也可以出现黄疸，如眼睛黄、皮肤黄、尿黄，如果为严重黄疸也可以出现浓茶水样尿。如果患者出现困倦的感觉，要除外是否出现肝损伤，需要到医院进行肝生化的检测。
