肝癌和肝囊肿在CT报告上存在非常大的区别，因为肝癌是实性，囊肿是囊性，一个是一团肉，一个是一包水，所以从CT上可以非常明显地区分开。另外，肝癌的内部是肿瘤，由于存在血液供应，打造影剂之后就会出现强化，而造影剂的排空又比正常肝组织快，所以呈现出快进快出的表现。肝囊肿内部是液体，没有血管成分，所以打造影剂增强之后，肝囊肿仍然呈现一种低密度，通过CT就可以把肝癌和肝囊肿进行鉴别诊断，在临床上也不容易出现这样的误诊。
肝囊肿通过超声基本上可以确诊，而肝癌容易和肝脏的实性占位性疾病相混淆，比如早期肝癌容易和不典型的肝血管瘤相混淆。肝脏较大的恶性肿瘤合并感染，容易和肝脓肿相混淆，而肝癌又包括原发性肝癌和转移性肝癌，影像学特点又存在着差异。
