碘伏如果误入眼睛，可能出现结膜和角膜损伤，造成角膜炎或结膜炎。碘伏损害和刺激性较小，如果少量碘伏进入眼睛，眨眨眼睛或使用清水进行清洗，可以自然好转。
如果大量碘伏进入眼睛，同时持续时间比较长，则需急诊清洗，可以用大量自来水或桶装饮用水等干净水进行清洗。通常在医院清洗眼睛，一般会使用≥200ml水，家中可以使用＞200ml水清洗。通过清洗将碘伏浓度稀释或冲洗干净，然后去医院就诊，请医生进行眼科检查，明确是否造成结膜炎或其它损害。
医生经过裂隙灯或仪器检测，可发现碘伏是否对眼睛造成较为严重的损害或形成较重炎症。如果炎症比较严重，可以用眼药水或眼药膏进行治疗，一般经过3-7天治疗，碘伏对眼睛造成的损害可以恢复，一般不会造成永久性损害。
