若想要彻底杀灭耳道内真菌，患者可以应用抗真菌软膏，如酮康唑软膏、氟康唑软膏等。此类患者可以使用较细长的棉签，在头部涂抹抗真菌软膏后伸入外耳道，将耳道深部到耳道口全部涂抹一遍即可。但对于多数患者，上述涂药方式的操作相对较困难，也可能由于不敢过于深入而导致涂抹效果不佳。

此类患者还可以选用较短块的纱布，将抗真菌软膏涂抹于纱布表面并放置入耳道内，由深入浅逐渐铺在耳内。抗真菌纱条可以在耳内置入48小时左右，再由耳鼻喉科医生取出。经过数次治疗后，外耳道真菌即可被杀灭。