扁桃体肥大其实没有特别好的药物可以控制。如只是一过性的扁桃体肥大，比如这段时间有感冒、有发热，造成的扁桃体肥大，就只需要去治疗原发病即可。
比如引起扁桃体肥大的，像急性上呼吸道感染，把急性上呼吸道感染治疗好，嗓子不痛，扁桃体体积就会比原来缩小，也就算治疗扁桃体肥大。
但是，如果在没有炎症的情况下，扁桃体就是很大，其实药物治疗的效果并不是非常好。如果想要治疗，可以试一试使用孟鲁司特钠颗粒口服，缓解淋巴组织的变态反应，看看是否能够达到缩小扁桃体体积的效果。但是个人觉得，这个效果通常来讲不会太好。
如果扁桃体非常的大，达到阻塞气道，造成睡觉打鼾，吞咽困难，大块食物没有办法咽下去，而且扁桃体频繁发炎，每年超过4-5次。这个时候需要考虑手术治疗，使扁桃体恢复到正常的大小。或者把作为病灶的扁桃体全部切掉，才能够改善扁桃体肥大带来的症状。
