结肠镜检查是否需要进行核酸检测，需要咨询预约胃镜及结肠镜的医院。目前北京地区，无论是哪个医院，进行胃镜及结肠镜这类侵入性检查，以及接种新型冠状病毒疫苗时，均需要进行核酸检测。
除外核酸检测，进行结肠镜检查及胃镜检查时，还需要通过排查乙肝、丙肝、梅毒、艾滋这免疫四项，而排除有创检查后传染病经血行传播的可能。若进行无痛检查，还会进行血常规、C反应蛋白、生化全项、心电图检查，了解麻醉风险及心脏情况。
若在内镜下进行活组织检查，尤其是进行内镜下治疗，如ESD(内镜下黏膜剥离术)等创面较大操作时，还需要进行凝血功能检测，避免因凝血功能异常而引起出血量大，导致止血困难。
