先天性房间隔缺损手术首先要把握好手术时机，原则上这类病人要早期发现、早期治疗、早期干预、早期康复，预后会更好些。对于一些先天性房间隔缺损不是很大、有治愈可能性的病人，可能让其先等待，再针对每个病人的个体情况选择最佳的治疗时机。
先天性房间隔缺损手术的注意事项与病人选择的方式有关，如果病人更适合开胸，就按照开胸手术方式的相应注意事项去把握。如果先天性房间隔缺损更适合介入封堵，可能就按照介入封堵、微创的方式遵守注意事项，比如后期要服用阿司匹林、避免剧烈运动。
不管采用何种手术方式，先天性房间隔缺损手术的安全性较强，成功率也很高。
