志贺菌主要引起的疾病有以下几种：

1、细菌性痢疾：可以引起普通型的细菌性痢疾，主要表现为高热，伴有腹痛、腹泻、排黏液脓血便。可以出现全身的感染中毒症状，畏寒、寒战、头疼，全身关节、肌肉酸痛，全身乏力，一般排便次数比较多。由于志贺杆菌侵犯的部位主要是在直肠和乙状结肠，所以患者始终会有排便的感觉，排便次数比较多，但每次排便的量比较少，只是一些局部炎症的渗出物，粪质相对比较少，可以出现左下腹压痛；

2、中毒型痢疾：普通型的痢疾相对比较多见，但也有极少一部分患者，会出现中毒型的痢疾，尤其会见于比较健康的儿童。可能是由于过敏，或者其他的机制引起，到目前为止，中毒型痢疾发病的机制不是非常清楚，但主要的致病物质是内毒素。可以引起全身的感染中毒症状加重，出现低血压休克，或者出现中毒性脑病；

3、慢性菌痢：细菌性痢疾如果治疗不及时，或者病情迁延，可以引起慢性菌痢。尤其是福氏杆菌引起的痢疾，可以出现慢性菌痢。如果病程超过2个月，考虑为慢性菌痢；

4、溶血尿毒综合征：志贺杆菌可以产生外毒素，极少一部分患者可以引起溶血尿毒综合征，但相对几率不是非常高。