酒精湿巾可以擦阴茎，但会比较疼痛，通常不推荐。因为酒精对阴茎，特别是龟头、包皮等娇嫩皮肤，杀伤力较强，会导致刺痛。因此即使临床手术进行消毒，均会对会阴部，包括阴茎、阴囊使用刺激性较小的消毒液。身体其他部位，如手、腹部、背部等，均可以使用酒精擦拭消毒。即使在麻醉时，患者麻醉苏醒仍会有刺痛，所以不推荐使用酒精湿巾擦拭阴茎。
如果担心局部卫生，应注意勤换内衣裤，勤洗澡，如果是包皮过长的男生，应仔细冲洗龟头部位。反复包皮炎，甚至包茎的男生，建议尽早做包皮环切手术，才能保证包皮、龟头的健康卫生，防止包皮炎反复发作，甚至长时间的包茎会有诱发阴茎癌的风险。
