肝脏介入治疗的副作用主要包括介入插管引起的物理性伤害，以及通过介入注入到肝脏内部的血管栓塞剂、化疗药物等引起的药物不良反应。

介入治疗是目前临床上用于中晚期肝癌的主要治疗手段之一，也可用于胆道梗阻、门静脉高压症等。通常肝脏介入治疗是通过穿刺，将导管送入到肝动脉或者是肝脏内的胆道系统，以达到动脉灌注药物、切断肿瘤的血供。同时给予化疗药物，控制肿瘤的生长。
胆道穿刺引流则主要用于梗阻性黄疸的治疗，穿刺会引起局部出血、疼痛，有的人会出现胆瘘，甚至是腹腔内大出血的风险，但这种概率比较低。部分会出现继发性感染，表现为发热等。

如果肝脏肿瘤较大，通过介入打入栓塞剂和化疗药物，可以引起肝脏肿瘤明显坏死，会出现剧烈的上腹部疼痛，也会引起明显的肝功能受损，严重情况会出现肝功能衰竭。

个别病人也会由于大面积的肿瘤坏死，释放坏死物质而引起全身反应，表现为乏力、恶心、呕吐，甚至是出现急性肾功能损伤等。