褪黑素影响性功能，褪黑素是大脑松果体分泌的激素，具有抑制下丘脑-垂体-性腺轴分泌性激素，可以降低垂体促性腺激素释放激素，降低肾上腺促性腺激素分泌，直接作用于睾丸，引起睾丸分泌性腺激素明显降低，会导致睾酮水平降低。男性在口服大量的褪黑素后，容易导致性欲明显下降。
在青春期前后的男性，如摄入较多的褪黑素时或体内由于松果体肿瘤，导致褪黑素分泌增多，会导致明显性发育障碍，出现性腺明显缩小，如睾丸明显缩小、睾酮水平明显降低，还会出现小阴茎现象。男性在摄入褪黑素后，还容易导致性欲障碍、夜间去甲肾上腺素分泌增多以及勃起时勃起不坚、勃起不硬，出现阳痿、早泄现象。
