引起耳朵疼的原因常见有以下几种：

1、外耳道来源：耳朵分外耳、中耳和内耳，外耳与中耳的分界线在鼓膜上，鼓膜以外的皮肤和皮下组织较薄，皮下有丰富的神经末梢，当外耳廓、耳道出现炎症或者受到外伤，会有明显的疼痛，是耳痛的来源之一。如果患者在挖耳朵或拿棉签掏耳朵、耳朵进水之后，出现明显的耳朵疼，可能为外耳道皮肤来源，需要在外耳道应用部分抗生素，同时保持外耳道干燥后，疼痛、炎症可以得到较快缓解；

2、中耳来源：部分中耳炎症不伴有鼓膜穿孔或流脓时，会引起负压，带动鼓膜内陷。鼓膜表面有丰富的神经末梢，鼓膜内陷时，患者耳朵深方的疼痛会向耳朵下方到嗓子方向去放散，多见于感冒、坐飞机，鼻子或者鼻窦发生急性感染之后，出现中耳炎症，同时部分患者还带有耳朵闷堵感、听力下降或耳鸣。出现上述情况的耳痛，应该到医院去进行及时治疗，可能需要鼻腔用药，缓解逆行感染，避免引起化脓和鼓膜穿孔。