防止患者肛瘘复发的关键取决于肛瘘手术术式。如果选择肛肠专科医院和专科医生正确操作，可减少肛管括约肌损伤，防止肛门失禁，是避免肛瘘复发关键，所以只有在正确操作之下才能防止肛瘘复发。

为防止肛瘘复发，饮食需以高纤维膳食为主，避免进食刺激性食物和长期饮酒，养成良好生活习惯，定时排便，便秘患者适当应用高渗性泻剂，改变排便习惯，注意肛门清洁。