食物从进食到排出体外，在体内的停留时间约为1-2天，便秘时可能时间更长，胃肠蠕动很活跃，平时容易拉稀的人，食物在体内停留的时间更少，具体时间因人而异。在生活中，前1天吃的食物，如早餐或者晚上吃的食物，可能第2天早上排出，可以通过实验观察，如吃木耳、金针菇，第2天观察粪便排出的时间，能够大致了解胃肠蠕动功能的状态。
食物在胃内的停留时间最长为4-6h，水在胃内的停留时间为0.5-1h，所以必须要空腹做的检查，在喝水2h后也能进行操作。蛋白质和淀粉类食物的排空时间为1.5-3h，脂肪类食物排空需2-4h，所以进食后4-6h，胃内可排空，继而食物进入肠道。
