直肠癌的复发率与直肠癌分期相关，一项临床研究发现对于Ⅱb、Ⅲ期的肠癌患者，术后两年内的复发率可能达到18%左右，通过中医药干预能降低患者的复发率。所以直肠癌的复发率关键与肿瘤确诊时是早期、晚期有关，早期其复发概率较低。
早期直肠癌患者手术以后五年生存率很高，一般五年生存率＞95%。如果分期较晚，比如直肠癌发现时肿块比较大，周围有淋巴结转移，或出现周围脏器的侵犯，属于局部晚期直肠癌。若还有手术指征，患者经过新辅助化疗放疗以后进行根治性治疗，患者五年生存率还可以达到50%左右。
如果出现远处转移，患者需要检测基因状态，最近一些临床研究发现，如果患者能够进行多项化疗、放疗、靶向、生物免疫治疗，患者五年生存率也较高。
