扁桃体长期发炎不会引起癌变，通常是慢性扁桃体炎，在扁桃体急性发炎期间病人会有高烧、咽痛及吞咽疼痛明显。检查时可以发现扁桃体充血、肿大、有脓性分泌物，经过抗炎治疗后即可消退。
少数扁桃体炎急性发作未控制良好或未及时治疗，反复迁延成慢性扁桃体炎，可以导致病人长期有咽喉异物感、烧灼感及反复出现感染。部分病人会出现远期并发症，如肾炎、风湿性关节炎、风湿性心脏病等，此时需要考虑扁桃体切除手术。同时存在病人扁桃体由于反复发炎导致肥大较明显，引起咽腔狭窄、打鼾，存在睡眠呼吸暂停综合征，也需要将长期发炎的扁桃体进行切除。
