不耐受通常指IgG介导的Ⅲ型变态反应，而过敏通常指IgE介导的Ⅰ型变态反应，其常见区别有以下几点：

1、发病率和发病时间：不耐受的发病率大概有50%，而过敏的发病率在1.5%左右。而且过敏比不耐受的发病更为迅速，过敏通常在进食敏感食物后2小时内发病，而不耐受通常是在2-24小时后出现反应；

2、发病人群：不耐受可发生在各个年龄段的人群，但过敏更容易发生于儿童，而成人相对偏少；

3、临床表现：不耐受有各种慢性症状，人体各组织器官都可能受累，表现为慢性腹泻、皮疹、慢性咳嗽、关节炎、胸痛、疲劳等，同时由于起病隐匿、涉及食物较多，而且通常是喜欢吃的食物，因此患者难以自我发现不耐受食物。而过敏主要表现为急性，典型的过敏症状主要影响皮肤、呼吸道和消化系统，例如急性腹泻、急性咳嗽、呕吐等，因为发作迅速、涉及食物较少，而且通常是不经常吃的食物，所以患者容易自我发现敏感食物；

4、检测手段：不耐受主要是通过IgG抗体进行检测，过敏是通过IgE抗体，及皮肤试验进行检测；

5、治疗：不耐受患者应忌食不耐受食物，通常6个月后症状多数可以消除。而过敏患者需要免疫治疗和对症治疗，且由于无法根除，因此可能会有长期过敏现象。