新生儿消化不良主要引起消化系统的症状，如明显的腹胀、大便次数增加、排气增加、吐奶、积食等症状，严重的情况下还可以引起咳嗽、肺液增加等症状。新生儿消化不良不仅排便次数增多，大便的性质可能为水样，甚至大便成分中具有奶瓣的存在。新生儿不能很好地对奶瓣进行消化、吸收，体重增长并不理想，主要考虑为新生儿的消化不良。临床上较多见的是功能性的消化不良，见于喂养过多。
评估新生儿的生长发育情况，需要测量新生儿的身高、体重、头围等，平均新生儿7-10天需要恢复出生体重。若不能恢复出生体重，考虑为喂养不足。新生儿生长良好，但大便较少，需要考虑可能是胃肠道消化超负荷，出现了消化不良的问题。随后大概20-25天的时间，体重增长大概在800-1000g。若体重增长过快，可能是由于喂养过度引起，伴随有相应的消化不良症状，比如腹胀、胃肠道的不舒适、大便次数多、奶瓣多、吐奶等症状。
