治疗幽门螺杆菌的药物以及相应副作用通常见于以下情况：

1、抗生素：老年患者服用抗生素后会出现抗生素相关性腹泻，表现为大便不成形、较长时间腹泻，严重者甚至会出现带有黏液的脓血便。对于老年患者而言，根除幽门螺杆菌时应该慎重，可以在治疗过程中加用益生菌。并且在停药后，再服用一段时间益生菌，避免出现抗生素相关性腹泻；

2、铋剂：铋剂本身属于重金属，在服用过程中导致大便可能呈黑色，患者不用过于担心。但是铋剂不建议长期使用，铋剂过量应用后可能会沉积在肝、肾，对肝、肾功能造成一定影响；

3、质子泵抑制剂：在治疗过程中，部分患者出现烧心、反酸，导致长期依赖质子泵抑制剂。如果长期使用质子泵抑制剂抑酸，可以导致老年患者对细菌杀伤作用减弱，容易出现肺部感染症状。同时，胃酸有助于钙吸收，如果长期抑酸有可能会导致钙吸收欠佳，造成骨质疏松。此外，长期抑酸也可能会引起萎缩加重或胃部息肉生长，以及神经内分泌细胞增生现象。