临床中不存在有痛肠镜的分类，肠镜检查通常分为普通肠镜检查和无痛肠镜检查。无痛肠镜检查是在全身麻醉下进行，患者全程在睡眠中进行检查，没有痛苦。

普通肠镜检查是在患者清醒状态下进行检查，普通肠镜检查痛苦与否，主要取决于患者自身因素、医生操作水平。因为肠道弯曲，所以肠镜在进镜的过程中有一定的操作技巧。肠镜检查会存在一些轻微的腹胀，但是通常可以承受。若患者既往有腹部手术史或妇科手术史，周围的肠道可能会存在粘连。结肠镜进镜时会因粘连而引起牵扯，使患者发生不适症状，极个别患者存在无法耐受，建议其选择无痛肠镜检查。