男性感染滴虫后，有相当一部分人可能没有症状，只是带虫者，但可以传染给配偶。另外，滴虫可能感染尿道、前列腺并引起症状，包括引起非特异性尿道炎，即出现尿急、尿频、尿痛或者尿道有烧灼感、不适感；还可以出现比较清亮的分泌物，量不多，时有时无；少数患者可出现脓性分泌物。

男性前列腺液中有抗滴虫成分，所以部分滴虫患者可以自愈。但也有一部分滴虫会持续存在，甚至感染到前列腺引起前列腺炎。男性滴虫病要积极治疗，因为滴虫能够吞噬精子，会导致不孕不育。一般男性滴虫病的症状主要以尿道炎为主，少数也可以刺激局部龟头、包皮部位，引起炎症反应，但一般采取甲硝唑类药物治疗症状会较快好转。