甲状腺结节如果发生疼痛，一般情况下都是良性。甲状腺结节疼痛通常有以下几种原因：

1、甲状腺结节囊内出血；

2、甲状腺炎，如急性甲状腺炎或者慢性桥本甲状腺炎，均可能发生疼痛。

所以甲状腺结节如果发生疼痛，良性的可能性大。但是甲状腺癌也有可能发生疼痛，比如甲状腺癌发生囊内出血，也可能疼痛，需注意鉴别诊断。