阿托品为M胆碱受体阻断药，能解除平滑肌痉挛，包括解除血管痉挛，改善微血管循环，抑制腺体分泌，解除迷走神经对于心脏抑制，使心跳加快，扩大瞳孔，使眼压升高，兴奋呼吸中枢。临床用于抢救感染性中毒性休克，治疗锑剂引起的阿斯综合征，治疗有机磷农药中毒，缓解内脏绞痛，可用于麻醉前给药，用于眼科扩瞳，调节功能麻痹。用于角膜炎、虹膜睫状体炎。该药为处方药，必须在医生指导下用药。
常见的不良反应有便秘、出汗减少、口鼻咽喉干燥、视力模糊、皮肤潮红、排尿困难，尤其是老年患者会出现口干，特别是男性。少见不良反应有眼压升高，过敏性皮疹或疱疹。用药过量表现为动作笨拙、不稳、神志不清、抽搐、幻觉、谵妄，多见于老年患者。呼吸短促与困难、言语不清、心跳异常加快、易激动、神经质、坐立不安，多见于儿童等。极大剂量可致惊厥、兴奋、视物模糊。静脉注射可有心脏停搏风险，有些患者可发生心动过速或者室颤。这种并发症可能由于用量超过1mg，但有时用量为0.5mg，也可引起上述并发症。过敏反应最常见的是接触性皮炎和结膜炎。使用阿托品眼药水滴眼时，有时引起刺激性结膜炎，使用时要压迫泪囊，尤其是儿童。经鼻泪管吸收可产生全身症状，主要表现为口干、唾液分泌减少、无汗、皮肤潮红、眩晕、心率加快，尤其是在颜面、颈部及躯干上部可能随之脱屑。