阴性、阳性是指乳腺癌免疫组化病理指标结果，这些病理指标是重要的治疗靶点，阳性要比阴性要好。重要的靶点包括ER、PR和HER-2。ER和PR的中文意思是雌激素受体和孕激素受体，如果是阳性，患者治疗的契机是内分泌治疗，可通过口服内分泌治疗药物降低体内雌孕激素，从而降低患者复发风险，达到延长生存期、降低死亡风险的目的。还有一个重要的指标是人表皮生长因子受体-2，即HER-2，以前认为阳性预后不好，阴性好，因当时没有开发出针对此指标的相应治疗药物。之后随着曲妥珠单抗、帕妥珠单抗等抗HER-2靶向药物的面市，HER-2阳性乳腺癌患者的预后得到明显改善。

抗HER-2阳性的靶向药物如曲妥珠单抗和帕妥珠单抗，是生物制剂，与化疗药物相比，副反应明显较轻，但却能明显延长患者生存期，降低复发风险。在抗HER-2靶向药物问世前，HER-2阳性乳腺癌患者的预后是所有分子分型中最差的类型。但是随着抗HER-2药物的出现及面市，目前已有各种抗HER-2药物，如曲妥珠单抗、帕妥珠单、T-DM1(拉帕替尼)、吡咯替尼、奈拉替尼。上述药物的综合合理使用，可提升HER-2阳性乳腺癌患者的整体预后，目前预后最差的分型是三阴性乳腺癌。