一般体外碎石手术对人体的伤害比较轻。体外碎石手术的原理是碎石机将能量聚焦在结石上面，能量的焦点在结石上面，可以将结石粉碎。能量要穿透人体部分组织，但由于能量虽然穿透组织并没有聚焦，所以对组织的影响比较小。一般在碎石之后，如果适当的口服抗菌素，同时保证两次碎石间隔不会过密。对于输尿管结石而言，保证两次碎石的间隔在1周以上。对于肾结石的患者而言，保证两次碎石间隔2周以上，就不会对人体产生影响，可以放心的接受治疗。
如果体外碎石手术过于频繁，输尿管结石碎石间隔在1周以内，或者肾结石碎石间隔在2周以内，甚至肾结石在1周之内，连续做两次体外碎石，对人体组织有轻微的损伤，有可能会导致局部皮肤的充血水肿、继发局部炎症等，所以建议控制好两次体外碎石之间的间隔。
