HPV39型阳性可能会通过性生活传染，而不是通过日常的生活方式、生活接触传染。所以女性如果感染了HPV39型，这种类型的HPV病毒不用担心因为生活中的接触而传染给别人。
一般当男性生殖器携带有HPV病毒，如HPV39型病毒时，可能会在性生活女性机体抵抗力下降，并且出现阴道黏膜局部破损的情况下，导致女性感染HPV病毒。
女性感染HPV病毒以后，绝大多数都会通过自身免疫力将病毒自行清除。所以大多数女性感染病毒以后没有任何临床症状，也不会导致临床疾病。一般在8-12个月病毒会自行清除，自行转阴。但是仍然有少部分女性会出现HPV39型阳性持续性感染。如果出现HPV病毒持续感染，就有可能会引起女性宫颈癌和宫颈上皮内病变，或引起女性生殖道尖锐湿疣，这种情况需要密切随访观察，并且给予相应的随访处理。
