预防肛周脓肿两个重要因素，一是减少肛腺感染可能，二是保持大便通畅，应尽量减少便秘或腹泻等症状出现。如大便不成形或有黏液泡沫样大便，建议尽早完善肠镜检查，积极预防和治疗肠道疾病，如肠炎、肛裂、肛窦炎、肛腺炎、肛乳头炎、直肠炎、混合痔等肛门直肠疾病，防止感染形成脓肿。
日常生活中要注意肛门部清洁卫生，便后建议用温水冲洗肛门，勤洗澡，锻炼身体，增强机体抗病能力和免疫力。饮食建议多吃清淡、富含营养和纤维素的蔬菜、水果等，少吃辛辣、油炸、肥腻、刺激性食物，防止便秘和腹泻发生。如果发现会阴和肛门部位损伤，应及时处理。如果肛门部有坠胀、灼热刺痛感、异常分泌物等，应及早到医院就诊和系统治疗。
