干扰素治疗疣，首先要根据疣的性质，可以分为外用或系统注射使用，所以需要明确使用方法。如果是一般性的寻常疣，可以不用干扰素治疗，如果寻常疣为单发，可以通过冷冻方式，效果较好且确切，副作用较小，再有跖疣，包括外用的抗干扰素，也有系统注射的干扰素，从机理上来讲，对于部分扁平疣可以外用干扰素，也可以注射干扰素治疗。
干扰素治疗疣，外用通常无明显的副作用，但是有时治疗效果可能会表现不同。如果是系统注射干扰素，就会有一定的副作用，因为干扰素具有抗病毒、抗肿瘤以及免疫调节的作用，如果是第1次注射，可能会有感冒样的症状，包括全身无力、低烧以及酸软等。如果个人机体是正常健康人群，一般都能够耐受此种副作用，同时也是一过性症状，通常在注射第2次时症状就会消失。
