肝癌患者除了做影像学检查来发现异常占位以外，诊断肝癌还需要血液方面的标志物。经典标志物有多种，如甲胎蛋白、CA19-9即糖类抗原19-9，CEA即癌胚抗原，γ-转肽酶同工酶，此外还有凝血酶的同工酶，上述标志物对肝癌诊断具有一定提示意义。
但是在所有的肝癌标志物里面，甲胎蛋白最具有典型意义。如果患者没有原因可以解释的甲胎蛋白升高，比如甲胎蛋白值为100mg/L，甚至达到200mg/L以上，并且患者没有肝脏炎症活动，但通过影像学发现肝脏有占位，则对于肝癌的诊断便是八九不离十。
除检查肝癌标志物外，对于肝癌的诊断更重要的是通过各种影像学检查手段，去发现肝脏内部的占位。此外再结合肝癌标志物，才可以有效、正确诊断肝癌。
