在月经期的时候不能用乳杆菌活菌胶囊，主要的原因就是在月经期的时候，月经血不断地从宫腔经过阴道排出体外。而乳杆菌活胶囊是塞到阴道后穹窿部，塞进药物后很快药物就会融化，然后会随着月经血一起排出体外。
一方面是药物达不到相应的疗效，另一方面在塞药的过程中，有可能会使一些细菌带入到阴道中。而月经血不断地流出，对细菌又是很好的培养基，所以会导致大量的细菌繁殖，引起阴道炎、宫颈炎甚至是子宫内膜的炎症等。
所以在月经期不能用乳杆菌活菌胶囊，建议在月经干净之后再用这种药物。并且在用药的时候一定要注意不要吃其他的抗生素，因为它是活菌胶囊，用其他的抗生素有可能就把活菌杀灭或抑制了，起不到相应的作用。这种药物主要是用于阴道局部乳酸杆菌减少，局部抵抗力下降。
