反复发低烧的原因多种多样，既可以是感染性疾病，也可以是非感染性疾病，具体如下：

1、感染性疾病：如结核、布鲁菌病，特殊的病毒、真菌、细菌也可以引起长期低烧。在遇到长期低烧的情况时，要寻找感染的病灶到底在什么地方，因为感染的病灶有可能在比较好找的位置，比如呼吸道、泌尿道、消化道，但也有可能在特别隐蔽的地方，比如肝脓肿、心内膜炎、肛周脓肿，甚至在中枢神经系统；

2、非感染性疾病：比如免疫紊乱、肿瘤性疾病。