治疗胆囊管结石的方法是及早手术切除胆囊，以及含有结石的部分胆囊管。因为胆囊管是连接胆囊与胆总管的过渡性管道，内径大约只有0.3cm，因此结石一旦进去以后容易形成持续性的嵌顿，较难再出来。

胆囊如果强行收缩，胆囊结石有可能经过胆囊管进入胆总管，一旦进入到胆总管里，处理就会变得比较复杂。患者可能需要通过打开胆总管的方式，取出胆总管的结石，或者通过ERCP(经内镜逆行性胰胆管造影)，即内镜的方式，从胆总管的下端取出结石。上述方法比胆囊切除要复杂得多，患者付出的代价较大，风险较高。

结石在胆总管里，如果没有得到及时处理，还有可能诱发胆管炎、胰腺炎，而胆管炎与胰腺炎有可能直接威胁患者的生命，是比较重症的情况。因此如果胆囊管结石没得到及时治疗，有可能会诱发较严重的并发症。

而部分患者的胆囊管结石虽然没有掉到胆囊管里，但是会变得越来越大，此时有可能压迫胆囊管，形成胆囊管胆总管漏，称为Mirrizzi综合征，此类患者的治疗会比较复杂，一次手术可能没有办法进行完整地修复。因此胆囊管结石无论大小，都建议患者早期手术，尽可能避免严重的并发症出现。