跖疣是脚上长的瘊子，既然和病毒感染有关系，要用抗病毒的药物，比如干扰素凝胶。但是单靠干扰素凝胶这一个药显然不够，因为患者还有细胞免疫功能下降的情况，所以还可以加上口服的调理机体免疫的药物。
一个药是干扰素凝胶，它能通过免疫抑制原理能够抑制病毒滋生。另外，还有一个药是咪喹莫特乳膏，也对病毒的滋生有一定抑制作用，同时还有免疫调节的作用，通过免疫调节达到治疗的目的。还有维A酸乳膏它可以抑制角化异常，因为脚上长了一个跖疣还有角化异常，就是皮肤角质层高度增生，很坚硬的隆起。维A酸乳膏也就是维甲酸类的药物，可以溶解角化异常的皮肤，从而使增生变平，目的就是让药物渗进去，达到治疗的作用。
所以脚上长跖疣，外用药再加上口服药，通过这样的综合治疗，才能达到理想的效果。
