5岁男孩小鸡疼是指阴茎疼，这种情况首先考虑是包皮龟头炎。仔细观察会发现有包茎或者包皮过长的表现，一般表面会红肿，有脓性的或者血性分泌物，甚至局部红肿后有水疱形成，在排尿过程中也可能有疼痛表现。

出现这种情况以后，首先要让男孩多喝水、多排尿，让尿液冲刷局部，可能会起到非常好的治疗作用。或者用红霉素眼膏抹在孩子的尿道口周围、包皮口周围，起到较好的消炎杀菌、止痒止痛作用。

如果男孩不但阴茎疼，而且在排尿过程中也有疼痛，可能有包皮龟头炎诱发的尿路感染情况。部分男孩可能还有尿频的现象，刚去卫生间又要去，但每次去排出几滴尿或者一点尿，同时尿道有灼烧感、异物感，有一种针扎刀刺样的感觉，是典型的尿路感染情况。

这种情况包皮龟头炎可能是继发所致，是由于尿路感染诱发的包皮龟头炎，部分包皮龟头炎是原发性。因为天气炎热、饮水少、排尿少，在出汗多的情况下局部细菌滋生，因为包皮过长覆盖龟头，一些分泌物不容易排出，在这种环境下诱发男孩的包皮龟头炎。

所以5岁的男孩阴茎疼，首先要考虑以上两个因素，其他像外伤、蚊虫叮咬因素也有。可以仔细查看局部的情况，根据不同的情况来进行处理。