大部分学说认为肿瘤是由基因驱动而形成的一类恶性疾病，驱动基因的检测就成为目前主要的治疗前的检测手段。针对驱动基因的改变包括突变、融合、基因扩增以及过表达，都有相应的靶向治疗药物，称为靶向治疗。

针对EGFR的肺部靶向治疗药物称为EGFR-TKI，针对ALK融合基因的药物称为ALK-TKI，或者有其他的ROS1阳性或者BRAF阳性的病人等，都有相应的靶向药。

靶向药直接针对驱动基因改变引起下游通路异常激活，主要是针对靶点通过对异常基因的变化，从而阻断下游通路的激活，导致肿瘤生长受限治疗肿瘤。靶向药相对具有一定的特异性而且有针对性，有效率相对比较高，全身的副反应又相对比较小。

化疗通常称为细胞毒性的药物，针对细胞生长周期和代谢有不同药物的药理机制。但是化疗药物通常具有细胞毒性，可以通过口服和静脉进入体内，但是药物通常对肿瘤细胞以及正常细胞都有一定杀伤能力。

所以化疗引起的副作用相对大一些，相比靶向治疗，副作用可能主要表现为骨髓毒性、消化系统毒性，包括肝功能、肾功能以及循环系统等毒性相对大一点。靶向药与化疗药二者相比，靶向药有效率更高、副作用更小、患者更容易耐受。化疗药副作用相对比较大一点，而且有效率不及靶向治疗。

在进行临床选择的时候，如果发现有驱动基因阳性首选靶向治疗，属于一线的推荐标准。如果没有明确基因突变的生物标志物，没有靶向治疗可以用，化疗也作为治疗的基石而存在。