蝶窦囊肿通常不会自愈，大部分都需要手术治疗。蝶窦囊肿是长在蝶窦里面的囊肿，早期如果囊肿较小，可能没有任何症状。
如果囊肿较大，压迫骨质导致骨质吸收，可能会有症状，包括枕部疼痛、流脓、视力下降等问题。因为囊肿可能会压迫视神经，所以建议进行手术干预，可以在全身麻醉状态，内镜下进行手术，把蝶窦的开口打开，把囊肿弄破，然后慢慢把囊壁取出。
蝶窦周围有非常重要的颈内动脉以及视神经，切除蝶窦囊肿一定要小心慎重，需要检查囊肿和视神经、颈内动脉的关系。
如果是颈内动脉管壁的骨质已经缺损，颈内动脉跟囊肿紧密粘连在一起，可能需要查血管造影，检查是否有血管瘤的情况，如果没有才可以手术。如果有血管瘤，手术风险较大，有可能导致术中大出血，甚至有死亡的可能性。
