甲状腺穿刺活检并没有太大危害。如果甲状腺出现结节，做B超达到Ⅲ期，或者ⅣA的程度，既不能确定是良性，也不能完全确定是恶性，此时通常就需要做甲状腺穿刺活检来决定需不需要手术。
如果甲状腺穿刺活检结果是良性，就可以继续观察，不需要做手术，如果甲状腺穿刺活检病理诊断是恶性，就要赶快决定做手术，因此穿刺活检比较必需。目前甲状腺穿刺都是在B超的引导下，通过细针穿刺取出甲状腺的组织来做病理检查。
此时的穿刺会比较准确，而且对人体伤害是很小，一般情况下对人体没有危害，除非巧合的情况下，穿刺的时候碰到血管，可能会引起甲状腺内出血的情况。但是这种几率比较小，因此甲状腺穿刺活检比较安全，可以信赖，没有必要发生恐惧。
