尿道出现细菌感染，需使用敏感抗生素进行抗感染治疗以杀灭细菌。尿道外口与外界相通，所以细菌易从尿道外口逆行进入体内，最先进入尿道，所以尿道、膀胱的炎症较常见。其中以革兰氏阴性杆菌较为常见，如大肠杆菌等在尿道内定植后，可引起尿道炎。
这时可选用能覆盖上述常见病原体的抗生素治疗，如针对革兰氏阴性杆菌感染，可选择喹诺酮类抗生素，如左氧氟沙星，还有头孢类抗生素，包括头孢呋辛、头孢克肟、头孢地尼等第二代、第三代抗生素，能较有效覆盖革兰氏阴性杆菌感染。部分患者反复出现感染或出现耐药性，这时可能需留取尿液做尿培养检测，再在药敏试验指导下选择敏感抗生素治疗。
