肾炎和咽炎之间可能关系不大，但是也不排除一些特殊类型的事件，因为肾炎患者本身疾病，是由于免疫系统异常造成的机体免疫失衡，也可以造成机体免疫力的降低，容易受外源性病原微生物的侵蚀，造成咽炎的发生。

不管是细菌还是病毒，同时某些肾炎患者服用大量的药物，特别是免疫抑制剂，例如糖皮质激素或者其他的免疫制剂，容易造成机体免疫力的下降。

机体对于病原微生物侵入的抵抗力严重下降，很容易发生咽炎以及其他部位的感染，最常见的就是呼吸系统的感染，这个时候咽炎是肾炎继发性因素存在。

有些肾炎，例如急性肾小球肾炎是由急性上呼吸道感染，特别是扁桃体炎、咽炎发作以后诱发的，这是由于链球菌感染、扁桃体炎或者咽炎以后，造成急性上呼吸道感染，诱发急性毛细血管内增生性肾小球肾炎，这就是急性肾小球肾炎。

从上述临床角度而言，咽炎在前，急性肾小球肾炎在后。所以治疗对于这种情况，需要应用抗链球菌的病原微生物的药物进行治疗，经过治疗一段时间以后，急性肾小球肾炎等痊愈，少部分遗留尿中非均一性红细胞增加和少量蛋白尿。