生化妊娠有可能是精子、卵子、受精卵的问题，还有可能没有办法找到任何原因。生化妊娠是指通过生化检查方法能够发现妊娠状态，但孕囊还未出现、妊娠还未继续就出现自然流产，此时如果没有进行检查，多数女性可能会误认为是一次月经来潮或延迟的月经来潮，所以并不是所有的生化妊娠都能被及时发现。
生化妊娠多数都在怀孕早期发现流产，其原因多数是受精卵的质量存在问题，即有可能多数存在染色体的基因问题。涉及到染色体的基因问题，有可能是来源于精子、卵子，也有可能是正常的精子和正常的卵子相遇、结合成受精卵，在受精卵进一步细胞分裂的过程中出现问题，所以生化妊娠的原因较多。如果生化妊娠反复多次出现，应该到医院进行相应的原因查找，由专科医生进行相应的检查及判断。
