巧囊指的是巧克力囊肿，巧克力囊肿手术后通常卵巢功能不会受到明显的影响。巧克力囊肿手术根据手术部位、手术范围不同会有较大差别。
考虑巧克力囊肿发病的高发年龄段是生育年龄的女性，进行巧克力囊肿手术时为了保留她的生育能力，所以不会对卵巢造成特别严重的功能上的破坏。
进行巧克力囊肿手术时，会比较轻柔的将囊肿的病变部位切除，尽可能保留较多的卵巢皮质、髓质。无论采取电凝或是手术缝线缝合的方法，都能达到非常确切的止血目的。
同时女性的卵巢功能非常强大，保留少许卵巢皮质、组织，通过充足的血液循环，未来排卵、受孕不会有较大影响。所以为了保护生育力、卵巢功能，需要避免巧克力囊肿持续性变大、反复破溃导致周围的粘连，影响卵巢功能，建议进行手术。
