乳腺结节手术后的囊肿处理如下：

1、本身结节位置手术切除后存在空腔，若为开放手术，手术医生多可进行缝补。但如果采用微创手术，空腔因未进行缝合，可能在术后复查时发现存在囊性肿块，这种情况多由局部积液引起，无需过分担心。此外，其他部位出现囊肿，如乳房肿块在此处切除，其它位置出现囊肿也需注意。此时如果B超检测为囊性肿块，同样无需过分担心，定期随访、复查即可；

2、如果囊肿变化很大可采用相应处理，手术抽出积液。

因此，根据囊肿具体情况，大部分情况囊肿无需特别干预，但在术后随访、复查中若囊肿出现短时间增大或囊腔内有絮状物产生，或周围出现钙化点、血流信号，需要及时进行处理和干预，因为此时有可能出现囊肿恶变。